Институт создан 1 июня 1971 года на базе Отдела технической кибернетики Дальневосточного филиала СО АН СССР и Объединенного вычислительного центра вузов г. Владивостока и ДВНЦ Сибирского отделения АН СССР.

В настоящее время Институт занимает ведущие позиции на Дальнем Востоке России в области физико-математических и технических наук. Широким фронтом ведутся исследования в области теории управления сложными системами и подводными роботами, в области математического моделирования сложных систем, информатики, спутникового мониторинга природных процессов, механики твердых тел, жидкости и газов, оптоэлектронных методов исследования газообразных и конденсированных сред, физики поверхности твердых тел и физики полупроводниковых наноструктур.

В штате ИАПУ ДВО РАН работают 260 сотрудников. Среди 117 научных сотрудников - один действительный член РАН и три члена-корреспондента РАН, 6 Заслуженных деятелей науки РФ, 1 Заслуженный изобретатель РФ, 29 докторов и 67 кандидатов наук, которые ведут исследования по таким актуальным областям наук как проблемы управления, математическое моделирование сложных систем, информатика, механика, лазерная физика, оптоэлектроника, физика поверхности твердых тел, наноматериалы, нанодиагностика и нанотехнологии.

В ИАПУ ДВО РАН выполняются исследования по Программам фундаментальных исследований Президиума и Отделений РАН, грантам РФФИ, РГНФ и ДВО РАН, госконтрактам Минобрнауки и Минобороны РФ, заданиям федеральных и региональных органов государственной власти.

Высшим признанием заслуг Института является присуждение его сотрудникам одной Ленинской премии, двух Государственных премий РФ и золотой медали РАН им. С.А. Чаплыгина за цикл работ в области механики неупругих сред.

В настоящее время в Институте успешно работают четыре ведущие научные школы по квантовой электронике, по динамике жидкостей и газов, по физике поверхности полупроводников и по теории упругопластических деформаций в твердых телах.

Институт имеет в своем составе четыре Центра коллективного пользования ДВО РАН:

• Центр спутникового мониторинга окружающей среды ДВО РАН
• Дальневосточный центр диагностики поверхности твердых тел
• Центр коллективного пользования уникальным аналитическим оборудованием ДВО РАН "Дальневосточный вычислительный ресурс"
• Центр "Лазерные методы исследования конденсированных сред, биологических объектов и мониторинга окружающей среды".

Все Центры оснащены современным аналитическим оборудованием для проведения фундаментальных и прикладных исследований.

Подготовка молодых научных кадров ведется в двух научно-образовательных центрах института физики и информационных технологий ДВГУ), а также на восьми базовых кафедрах от трех Университетов (ДВГУ, ДВГТУ и МГУ им. Г.И. Невельского). В Институте активно работает аспирантура и три докторских диссертационных совета по одиннадцати специальностям. Количество аспирантов - 43.)

Институт расположен в пригороде Владивостока на берегу живописного Амурского Залива (Японское море).